Kho bạc Nhà nước Khu vực XIX có 07 phòng và 19 phòng Giao dịch, cụ thể:
1. Phòng Kế toán Nhà nước
2. Phòng Nghiệp vụ 1: Kiểm soát chi vốn đầu tư xây dựng cơ bản Thành phố Cần Thơ
3. Phòng Nghiệp vụ 2: Giao dịch với đơn vị trên địa bàn Quận Bình Thủy
4. Phòng Thanh tra - Kiểm tra
5. Phòng Tổ chức - Hành chính
6. Phòng Tài vụ - Quản trị
7. Phòng Hỗ trợ Giao dịch và Công nghệ thông tin
8. Phòng Giao dịch số 1: Giao dịch với các đơn vị thuộc Quận Ninh Kiều, Quận Cái Răng, Huyện Phong Điền. Trụ sở đặt tại KBNN Cái Răng
9. Phòng Giao dịch số 2: Giao dịch với các đơn vị thuộc Quận Ô Môn, Huyện Thới Lai, Huyện Cờ Đỏ. Trụ sở đặt tại KBNN Thới Lai
10. Phòng Giao dịch số 3: Giao dịch với các đơn vị thuộc Quận Thốt Nốt, Huyện Vĩnh Thạnh. Trụ sở đặt tại KBNN Thốt Nốt
11. Phòng Giao dịch số 4: Giao dịch với các đơn vị thuộc tỉnh Hậu Giang, Thành phố Vị Thanh, Huyện Vị Thủy. Trụ sở đặt tại KBNN Hậu Giang
12. Phòng Giao dịch số 5: Giao dịch với các đơn vị thuộc TX Long Mỹ, Huyện Long Mỹ. Trụ sở đặt tại KBNN TX Long Mỹ
13. Phòng Giao dịch số 6: Giao dịch với các đơn vị thuộc TP Ngã Bảy, Huyện Phụng Hiệp. Trụ sở đặt tại KBNN Ngã Bảy
14. Phòng Giao dịch số 7: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện Châu Thành, Huyện Châu Thành A. Trụ sở đặt tại KBNN Châu Thành A
15. Phòng Giao dịch số 8: Giao dịch với các đơn vị thuộc tỉnh An Giang, TP Long Xuyên. Trụ sở đặt tại KBNN An Giang
16. Phòng Giao dịch số 9: Giao dịch với các đơn vị thuộc TX Tịnh Biên, Huyện Tri Tôn. Trụ sở đặt tại KBNN Tri Tôn
17. Phòng Giao dịch số 10: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện An Phú, TP Châu Đốc. Trụ sở đặt tại KBNN Châu Đốc
18. Phòng Giao dịch số 11: Giao dịch với các đơn vị thuộc TX Tân Châu, Huyện Châu Phú. Trụ sở đặt tại KBNN Châu Phú
19. Phòng Giao dịch số 12: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện Thoại Sơn, Huyện Châu Thành. Trụ sở đặt tại KBNN Thoại Sơn
20. Phòng Giao dịch số 13: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện Chợ Mới, Huyện Phú Tân. Trụ sở đặt tại KBNN Chợ Mới
21. Phòng Giao dịch số 14: Giao dịch với các đơn vị thuộc tỉnh Đồng Tháp. Trụ sở đặt tại KBNN Đồng Tháp
22. Phòng Giao dịch số 15: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện Tân Hồng, Huyện Hồng Ngự, TP Hồng Ngự. Trụ sở đặt tại KBNN TP Hồng Ngự
23. Phòng Giao dịch số 16: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện Tam Nông, Huyện Thanh Bình. Trụ sở đặt tại KBNN Tam Nông
24. Phòng Giao dịch số 17: Giao dịch với các đơn vị thuộc TP Cao Lãnh, Huyện Tháp Mười. Trụ sở đặt tại KBNN Cao Lãnh
25. Phòng Giao dịch số 18: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện Lấp Vò, Huyện Lai Vung. Trụ sở đặt tại KBNN Lai Vung
26. Phòng Giao dịch số 19: Giao dịch với các đơn vị thuộc Huyện Sa Đéc, Huyện Châu Thành. Trụ sở đặt tại KBNN Sa Đéc